本校諮商輔導中心自 86 學年度起負責統籌特殊教育學生之各項輔導工作, 89 學年教育部重點補助之特殊教育學生已達 8 人,獲教育部補助自 90 年 1 月 1 日 起設置特殊教育學生資源教室。
資源教室自 90 年 6 月 8 日 開始啟用,目前已規劃有辦公區、交誼區、課輔討論區、閱讀自修區及電腦作業區等提供學生使用。 期許本校資源教室的成立可以使特殊教育同學得到最妥善、全方位的服務,是特殊教育學生在雲科大學習生涯中一個充滿溫暖與愛,感性與知性兼具的溫馨家園。